Moleculair biologisch ecologisch onderzoek plant dier populaties

Onderwerp: Moleculair Biologisch / Moleculair Ecologisch onderzoek van natuurlijke plant en dier populaties
 
Vereiste opleiding en kennis: MBO / HBO / Universiteit (Werk word aangepast aan opleidingsniveau). Bij voorkeur ervaring met het praktisch uitvoeren van moleculaire technieken.
 
Status (stage of afstudeervak):
 
Stage of afstudeervak
Periode/duur: Minimaal 3 maanden
 
Inhoudelijke omschrijving:

Achtergrond:
Bij het onderzoek dat word uitgevoerd op het Moleculair Ecologisch laboratorium van het Centrum Ecosystemen word  gewerkt met zowel (on)gewervelden als planten. Op het moment ligt de nadruk op zoogdieren, vogels en bomen. Daarnaast word ook gewerkt met insecten, bodem macrofauna, reptielen en amfibieën.
Een breed scala aan moleculaire methoden word toegepast, waaronder technieken voor genotypering zoals microsatellieten, S-allelen, SNP-detectie en genetische barcoding met mtDNA, cpDNA of rDNA.
Er word veel gewerkt met non-invasieve en historische DNA monsters van een veelal lage kwaliteit en geringe kwantiteit, hetgeen zorgt voor de nodige uitdagingen.
Het onderzoek word vooral toegepast op de gebieden van forensische-, kwantitatieve-, moleculaire- en conservatie genetics en genomics.

Doel van het onderzoek:
Het onderzoek word zowel nationaal als internationaal ingezet voor het monitoren van populaties van allerlei diersoorten. Dit kan zijn na herintroductie van (bijna) verdwenen soorten zoals bijvoorbeeld otter, korenwolf en korhoen maar ook voor monitoring van (bedreigde) wilde populaties zoals wild zwijn, boommarter, adder en geelbuikvuurpad maar ook populier, eik of rooibos.

Beschrijving van het werk:
Gedurende de stage of het afstuderen zal vooral moleculair biologisch laboratorium werk worden verricht. Hierbij moet worden gedacht aan DNA extracties, analyse van kwaliteit van DNA en het uitvoeren van genotyperingstechnieken.

Daarnaast zijn er mogelijkheden voor het verrichten van veldwerk zoals het verzamelen van non-invasieve monsters en om te werken aan (statistische) analyse van de gegenereerde genetische data.
De werkzaamheden worden in overleg met de student vastgesteld. Hierbij word zo veel mogelijk uitgegaan van de interesses en stagedoelen van de student.
Er wordt altijd naar gestreefd om het werk zo veel mogelijk binnen één project (en dus meestal met één diersoort) plaats te laten vinden, zodat er een duidelijk afgebakend stage/afstudeer project ontstaat.



 

  
Print deze pagina